Zastosowanie grafowych sieci neuronowych w projektowaniu leków

⚫️ Wydarzenie na żywo – otrzymane materiały będą uzależnione od zakupionego wariantu

⚫️ Termin warsztatu: 📆 27 października 2024 ⏰ 9:00-17:00

🔴 Rejestracja na warsztat kończy się 25 października o godz. 14:00

➡️ Czego się nauczysz?

Podczas warsztatu nauczysz się, jak:
– Budować grafy i wykonywać na nich proste operacje,
– Generować grafy z cząsteczek chemicznych,
– Implementować, optymalizować i walidować grafowe sieci neuronowe (klasyfikatory i regresory).

➡️ Dla kogo jest ten warsztat?

Warsztat jest skierowany do osób, które:
– Trenowały już modele uczenia maszynowego, w szczególności sieci neuronowe i chcą poznać praktyki stosowane w sieciach grafowych,
– Chcą poszerzyć swoją wiedzę domenową z obszaru chemii i farmacji o podstawy informatyki chemicznej.

➡️ Wymagania wstępne

Na tym warsztacie wymagamy dobrej umiejętności programowania w języku Python oraz znajomość pakietu TensorFlow, PyTorch lub podobnego.

➡️ Program warsztatu:

1. Wstęp teoretyczny:
– Pojęcie grafu, rodzaje grafów i podstawowe algorytmy grafowe,
– Reprezentacje cząsteczek chemicznych,
– Zasada działania grafowych sieci neuronowych.
2. Przegląd podstawowych funkcjonalności bibliotek operujących na grafach:
– NetworkX,
– RDKit,
– PyTorch Geometric.
3. Eksploracyjna analiza danych:
– Kontrola histogramów cech,
– Kontrola wartości odstających,
– Porządkowanie danych wejściowych.
4. Grafy cząsteczek chemicznych:
– Generowanie,
– Analiza,
– Przygotowanie zbioru danych.
5. Grafowa sieć neuronowa:
– Trenowanie,
– Optymalizacja hiperparametrów,
– Walidacja.
6. Publikacja modelu dla użytkowników.

➡️ Informacje o prowadzącym:

Mateusz Rezler

Specjalista ds. Informatyki Chemicznej w Merck KGaA od 2020 roku. Na co dzień zajmuje się rozwojem i utrzymywaniem backendu aplikacji do retosyntezy „Synthia” oraz projektami na styku informatyki chemicznej i uczenia maszynowego. Doktor nauk medycznych i nauk o zdrowiu w dyscyplinie nauki farmaceutyczne oraz absolwent Bootcampu Data Science Pro w Sages. Chętnie łączy wiedzę domenową z programowaniem. Doświadczenie dydaktyczne zdobył na Warszawskim Uniwersytecie Medycznym. Szkolenia traktuje jako sposób na oszczędzenie czasu słuchaczom poprzez przekazywanie wiedzy w możliwie esencjonalny i prosty sposób.

➡️ Uwagi nt. uzyskania certyfikatu

Jeśli zakupiłeś/aś wariant z nagraniem warsztatu, do swojego zakupu możesz otrzymać certyfikat potwierdzający znajomość materiału merytorycznego, do którego dostęp wykupiłeś/aś. Warunkiem uzyskania takiego dokumentu jest uzyskanie pozytywnego wyniku z quizu podsumowującego. Szczegóły dot. tego tematu znajdują się w panelu nagrania.

Dostęp do Quizu pojawi się wraz z publikacją nagrania.